Функционал восстановления из бекапа есть, но давно не проверялся и к тому же не всё поддерживает. Например, точно нужна возможность восстановления зашифрованных бекапов.
В рамках этой задачи следует рассмотреть возможность выноса данного функционала в отдельный пакет (bitrix-cli-restore), т.к. название текущего пакета скорее говорит нам о установке из дистрибутива и это может путать. Но если окажется, что между двумя командами есть много общего кода, то лучше оставить всё в общем пакете, чтобы не переусложнять.