Les damos la bienvenida al Workshop Creación de paquetes de R/Bioconductor para el análisis de metagenomas!
Nos da gusto anunciar que la CDSB, junto con la Red Mexicana de Bioinformática (RMB) y el Nodo Nacional de Bioinformática en la UNAM (NNB-CCG), está organizando el taller Desarrollo de paqueterías de R/Bioconductor como parte del Encuentro Nacional de Bioinformática México 2024.
Todas las sesiones serán teóricas y prácticas. Nos enfocaremos en dos temas principales:
- Análisis de metagenomas
- Creación de paquetes de R/Bioconductor
- Dra. Mirna Vázquez Rosas Landa: Investigadora en el Instituto de Ciencias de Mar y Limnología de la UNAM.
- Dra. Joselyn Cristina Chávez Fuentes: Estancia Postdoctoral en Icahn School of Medicine at Mount Sinai.
- Dra. Yalbi I. Balderas-Martínez: Investigadora en el Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias Ismael Cosío Villegas.
- M.C. Erick Cuevas Fernández: Estudiante de Doctorado en la Universidad Nacional Autónoma de México.
- M.C. José Antonio Ovando Ricárdez
Consulta el calendario de este curso en: http://bit.ly/calendarcdsb2025
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Día 1: Estructura general de un paquete
- Presentación a la CDSB.
- Plática: La última versión del árbol de la vida y la metagenómica.
- Control de versiones con GitHub y RStudio.
- Creando la infraestructura de un paquete.
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Día 2: Documentación de un paquete
- Creando mis primeras funciones.
- Documentación de funciones.
- Diseño de pruebas.
- Creación de viñetas.
- Introducción a Conda
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Día 3: Reconstrucción de genomas
- El grupo de datos.
- Mapeo y Binning.
- Asignación taxonómica.
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Día 4: Reconstrucción metabólica e inferencia filogenética
- Análisis de vías metabólicas.
- MEBs (Multigenomic Entropy Based Score pipeline )
- Proyectos colaborativos de metagenomas.
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Día 5:
- Proyectos colaborativos de metagenomas.
- Presentación de proyecto.
- Clausura.
Puedes consultar el libro electrónico en: https://comunidadbioinfo.github.io/cdsb2025/
Agradecemos el apoyo de:
