-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 5
add sop-040-nl imageJ protocol #145
New issue
Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.
By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.
Already on GitHub? Sign in to your account
Conversation
|
|
||
| Laad de groepsfoto in via File \> Open | ||
|
|
||
| De groepsfoto’s bevinden zich in de map: `G:\Gedeelde drives\Procesbeheer\PB11\_Plotbemonstering\PB\_Plot_Invertebraten\FOTO\_SubPlot_Invertebraten\Groepsfoto` |
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
Deze lange foldernaam wordt niet volledig getoond in zowel de html als de pdf versie. Is het nodig om deze foldernaam in het protocol op te nemen? Kan je het algemener schrijven, bv "Sla de groepsfoto's op in een map met de naam Groepsfoto."?
Indien je dit toch wil opnemen in het protocol, dan zou ik volgende manier gebruiken:
```{r results = "asis"}
G:\Gedeelde drives\Procesbeheer
|-- PB11
|-- _Plotbemonstering
|-- PB
|--__Plot_Invertebraten
|-- FOTO
|-- _SubPlot_Invertebraten
|-- Groepsfoto
```
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
toch gebruiken
Co-authored-by: Hans Van Calster <hans.vancalster@inbo.be>
|
@Anouk4 ik heb zonet een wijziging aangebracht in deze branch (up to date brengen met main branch) waardoor je je lokale branch zal moeten updaten met "pull" knop in het RStudio Git pane (of commando "git pull"). Als je nog hulp nodig hebt met iets laat maar weten. En als je klaar bent geef maar een sein. |
Description
Binnen het Procesbeheerproject [1] worden in elk subplot twee keer per jaar stalen van ongewervelden verzameld: één keer in mei-juni en één keer in augustus-september.
In het labo worden de ongewervelden via triage uit het strooisel gescheiden en vervolgens per taxonomische groep gesorteerd.
Met dit materiaal worden (a) groepsfoto’s gemaakt, waarop per taxonomische groep het aantal individuen en het oppervlak wordt bepaald in ImageJ (zie hiervoor deze SOP), en (b) de exemplaren gedetermineerd en ingevoerd in waarnemingen.be.
Related Issue
Task list
Steps by contributor:
protocolhelper::check_frontmatter()and address themprotocolhelper::check_structure()and address themNEWS.RmdReview steps for the author(s):
protocolhelper::check_frontmatter()andprotocolhelper::check_structure()succeeded without errors.To be done by an administrator after review: see guidelines for admins.